Sinopsis Zoids/Zoids Classic/Zoids: Chaotic Century/Zoids: Guardian Forces/ゾイド: Di gurun terpencil di planet Zi, seorang bocah bernama Van menemukan fasilitas yang ditinggalkan dan bobrok. Di dalam, ia menemukan kepompong buram yang pecah sendiri, dan robot seperti dinosaurus yang dikenal sebagai “organoid” muncul dari cangkang. Van menamai makhluk Zeke dan mengklaimnya untuk dirinya sendiri, tetapi sekelompok bandit mengejarnya untuk merebut organoid. Bandit dilengkapi dengan unit mekanis “Zoids,” seperti binatang buas yang digunakan untuk pertempuran. Van mampu menangkis pengejarnya dengan menghidupkan kembali dan menggabungkan dengan zoid tua yang dijuluki “Liger Shield.”
Van kembali ke fasilitas dengan Zeke di belakangnya dan menemukan kepompong baru. Dia sangat gembira bahwa dia mungkin telah memperoleh organoid lain, tetapi ketika kepompong pecah, seorang gadis muncul darinya. Tidak menyadari asal -usulnya, gadis itu hanya ingat bahwa namanya adalah Fiona dan bahwa dia harus menemukan objek yang disebut “Zoid Eve.” Bertekad untuk memecahkan misteri di balik keberadaannya, Fiona bertualang bersama Van dan Zeke untuk mengungkap apa sebenarnya Zoid Eve. Ketiganya berjalan di banyak teman dan musuh dalam petualangan mereka, menghadapi berbagai bahaya dan mengalami irisan hati yang ringan saat mereka bepergian.
