Sinopsis Natsu no Arashi!: Di Jepang modern, Hajime Yasaka yang berusia 13 tahun pindah ke pedesaan untuk tinggal bersama kakeknya. Dalam perjalanan ke rumah barunya, Hajime yang tersesat menemukan dirinya berada di sebuah kafe bernama Ark, di mana dia langsung jatuh cinta dengan salah satu pelayannya: Sayoko “Arashi” Arashiyama yang cantik. Meskipun Arashi awalnya tidak peduli dengan anak laki-laki itu, sikapnya dengan cepat berubah setelah dia menggenggam tangan Hajime, membuatnya percaya bahwa mereka “terhubung”.
Ternyata, Arashi bukanlah remaja biasa—pada kenyataannya, dia adalah hantu seorang gadis yang tewas dalam Perang Dunia II. Dengan menyentuh pria yang berhubungan dengannya, dia memperoleh kemampuan untuk melakukan perjalanan kembali ke masa lalu. Senang telah menemukan seseorang yang dapat membuka kekuatannya, Arashi meminta Hajime untuk membantu misinya: menyelamatkan warga sipil dari pembantaian perang yang merenggut nyawanya. Terpesona dengan Arashi, Hajime langsung setuju. Namun ketika keduanya semakin terlibat dengan masa lalu Arashi, mereka segera menyadari bahwa dia bukanlah satu-satunya yang mampu melampaui waktu.
