Sinopsis Jibaku Shounen Hanako-kun 2/地縛少年花子くん2/Toilet-Bound Hanako-kun Season 2: Ada desas -desus di Kamome Academy bahwa di suatu tempat di tempat sekolah terletak jam yang mengatur berlalunya waktu di akademi. Jam itu diawasi oleh tiga penjaga jam – masing -masing mewakili masa lalu, sekarang, dan masa depan. Meskipun demikian, peristiwa yang tidak terduga menyebabkan kekacauan, dengan siswa dengan cepat menua dan infrastruktur akademi berantakan.
Nene Yashiro dan Kou Minamoto mencari bantuan dari Hanako-kun, memulai petualangan baru untuk menemukan mereka yang bertanggung jawab atas kekacauan ini. Namun, apa yang mereka temukan lebih dari sekadar identitas pelakunya. Ketika kebenaran tersembunyi terungkap dan sumpah baru didirikan, para siswa akademi dan penampakannya menemukan diri mereka dalam permainan nasib, di mana pertarungan yang hidup untuk membebaskan diri dari genggamannya.
