Sinopsis Hand Shakers: Mereka yang menerima Wahyu Babel harus mengatasi banyak pertempuran dan cobaan. Dengan menggenggam tangan pasangan spesial mereka, “Hand Shaker” ini membawa diri mereka ke dunia Ziggurat, sebuah dimensi alternatif di mana waktu sudah tidak ada lagi. Masing-masing pasangan Pengocok Tangan harus bertarung demi mendapatkan hak untuk bertemu dengan Tuhan, yang akan membalas mereka dengan mengabulkan satu permintaan.
Tazuna Takatsuki, seorang siswa SMA dengan kegemaran memperbaiki sesuatu, adalah salah satu dari Hand Shaker ini. Setelah menerima permintaan perbaikan dari Profesor Makihara dari universitas terdekat, Tazuna menemukan Koyori Akutagawa, seorang gadis yang terbaring di tempat tidur yang mengingatkannya pada mendiang saudara perempuannya, Musubu. Mengingat keinginan terakhirnya untuk tidak melepaskan tangannya, Tazuna menggenggam tangan Koyori dan membangkitkan kekuatannya sebagai Pengocok Tangan. Namun, kehidupan Koyori terkait langsung dengan statusnya sebagai Pengocok Tangan, yang berarti jika Tazuna melepaskan tangannya, dia akan mati. Dengan bertemu Tuhan sebagai satu-satunya harapan mereka untuk menyelamatkannya, keduanya harus menemukan cara untuk menyatukan kekuatan unik mereka, mengatasi Hand Shaker lawan, dan mewujudkan keinginan mereka.
